gnupack や Cygwin で make の際に
 multiple target patterns. Stop.
がでたら、コンパイルの際のパスにWindows的なパス（c:\hoge）とかが含まれている可能性がある。

さしあたり、.deps内のパスを書換えれば大丈夫なはず。

{{category2 ツール,Cygwin}}